朝聖：Johns Hopkins Hospital

Johns Hopkins，當過醫生的應該都有聽過，傳說離我家不到1小時車程。竟然來到美國一年多，要離開前才來朝聖。

再會啦，全台唯一的氣管內視鏡用的 Nd-YAG 醫用高能雷射

除了醫美之外，其實醫用雷射還是有它的立足空間的。這次介紹的，就是在我們單位服務了20多年的氣管內視鏡用的 Nd-YAG 醫用高能雷射：

Python 沒有 switch - case

雖然在用 Python，但還是算初學者，一堆指令的用法和細節，都常常要上網找語法來用。這次突然翻到，Python 沒有 switch - case，喔喔喔！！有人整理過各種程式語言的switch - case，想不到連古老的COBOL 85也有類似的語法，更不用講在Python之後的Ruby或Perl了。
我是還沒寫到這麼高階的功能啦，不過看看別人怎麼處理這個問題也好。其實，書上會寫，要用if...elif...elif...else來處理這個問題。但是也有人想直接改別人的c code或php code而不要重寫，所以才會想出這些處理方法。
主要的參考網頁為 azalea says及 ActiveState Code，其實可以看看ActiveState Code下面的討論串，原來一個簡單的問題，其實有蠻多不同的創意解決方案，而不是教科書上寫的單一教條。

第一個方法是用Dictionary，第二個方法其實也是用Dictionary，再加上lambda。第三個方法就比較貼近我想的，直接寫一個 class來處理，以下的code，是2005年Brian Beck 就寫好的，來自於ActiveState Code，在此宣告他們的版權。

[解決] 用 Python來開 Microsoft Access的.mdb資料檔的中文欄位問題

又開始沒事找事做，開始改之前寫好的程式了。

在之前的文章：用 Python來開 Microsoft Access的.mdb資料檔曾經提到

"pyodbc 是个很不错的库，api 也很好用，不过对中文支持的并不好"

我的經驗也是如此。原始資料庫的開發者沒事把欄位名稱用上中文，結果就是我花了好久時間，還是不能用sql語法的where來限制欄位的比對結果。

後來有熱心網友提供了他的心得：用微軟提供的元件 ADODB 來存取 Access。所以我也很快樂的在新版程式中 import這些功能。一個不錯的使用方法及副程式，可以在AlarmChang所維護的Python NoteBook中找到程式碼，基本上直接copy就很好用了。

但是，還是一樣，一但整份.py文件儲存時是使用utf-8，那就完了，一直出現error。
重點是，我突然發現，在

SQL = "Select * from TableABC"
rs = Connect_To_Access(SQL)

這一段，其實是丟一個字串(SQL)給Microsoft ADODB COM去解譯，那我丟的字串符合它要的編碼規定(在我之前的文章有提，就是用ansi儲存的編碼)，就可以了吧。

用 Python來開 Microsoft Access的.mdb資料檔

其實 Python算是蠻容易了解的語言，至少在語法上算是蠻貼近於我們使用的文字，加上眾多的函式庫的支援，幾乎就是你要的函式大多都可以找到。加上它算是網路世代的程式語言，在網路功能的支援也不惶多讓。不過，沒好好唸過程式語言的我，對於其中的物件還是不太熟悉。

我會使用Python，也是被逼的。當初要交程式報告時，實在是搞不懂要怎麼去get及put網頁資料。看過java及C，直覺並不是我可以在一個假日就完成這樣工作的。因為之前稍稍有看過Python的網頁，它的語法和basic，pascal或Matlab都蠻像的，而且可以查得到網頁相關的功能。

這幾年都接了單位的"品質"精進作業。每年都要想一個品質專案，因為有些事是不得搬上抬面的，所以大家都做些顯而易見，不傷大雅的議題。今年我特別抄去年的專案，只是用 Python寫好電子化的處理方案。在用Python處理時，遇見資料庫讀寫的問題，因為實在太少資料了，所以拿上來分享一下。

先說我的狀況：就是要去開一個已有的.mdb檔，讀出裏面的資料，再上傳到單位的網頁中。為了讀database檔，Python簡單解決方案為使用pyodbc，或是使用pypyodbc。兩者都可以讀一些主流的sql server，以及Microsoft excel和access的存檔。兩者的差異只有pypyodbc是純python的程式碼實作出來的。打開.mdb檔的方式如下：

###打開.mdb檔的方式

conn = pyodbc.connect('DRIVER={Microsoft Access Driver (*.mdb)};DBQ=c:\\dir\\file.mdb')
cursor = conn.cursor()
cursor.execute('select * from ProgressNote;')
###

氣管內雷射

常有人問我，我的專長是什麼。我制式的回答是：胸腔介入性檢查及治療。

但是什麼是介入性檢查及治療？基本上就是支氣管鏡檢查及治療、超音波檢查及治療。

最具代表性的支氣管鏡治療就是這個 (用影片來說比較快，所要講的也都打在影片中了)：


沒有個人資訊，應該不會侵犯隱私吧！

Case Report 和 impact factor

這一陣子幫 fellow們投 Case Report，可謂是吃力不討好。連續丟了好幾個 Journal都是 Reject。而且，一堆 Journal幾乎都不收 Case Report了，為什麼？

我們來看美國 Neth Heart J 怎麼樣來評 Case report的：

我們不太熟的老朋友：PENTAX 全電子式支氣管鏡 -- 離情依依

又有一個老朋友要離我們而去了。雖然說，胸腔部的同仁對它可能是又愛又恨，或是一點感情都沒有，但是它仍舊是默默的躲在牆邊守候著。

這次的主角是它，PENTAX EPM-3300 及 EB-1830T3系列的全電子式支氣管鏡-Videobronchsocpe 組。


這一組電子式的支氣管鏡，應該算是台灣第一組全電子式的支氣管鏡了吧。

程式專題之一：Part-1：py2exe 的小問題

經過2週和程式的奮鬥，基本上我那個程式是完成了。
但是程式是要給別人用的，所以就只好打包成exe檔。

python自己沒有compile成exe的功能。還好有人寫了py2exe的程序來做這件事。研究了一下，這位Victor寫的進階教學還算不錯，只是它打包的是程式本身，程式呼叫的DLL檔是沒打包起來的。

尤於我用的是python 2.7.2版，直接上py2exe的官網下載並且安裝。這個過程中出現了一個小插曲，py2exe的官網上直接給的是for python 2.6的py2exe，所以要再去它的下載目錄中找出for 2.7的py2exe來裝才可以。

那，程式呼叫的DLL檔要怎麼辦？只好再上網找答案。還好我是新手，新手會遇到的問題應該都不難。很快的在Frank的五四三就找到答案了。基本上在setup這個裏面要把參數設進去即可。這樣弄好，本來約200行的程式(我是新手，程式寫得很髒，行數很多，而且註解也很多)，compile起來約有7M。

接著拿去別的電腦測測看，嗶嗶~~ERROR。跳出一個message說程式沒裝好？？？只好再拜google大神了。大神指示往pyodbc去找答案。果然，答案就在網路中。這個問題是因為py2exe不認識我import的pyodbc，必須在setup中加個options來指定，如下：

setup(
options = { "py2exe": { "includes": "decimal, datetime" } })

如果有有指定別的option了，可以用"逗號"分開。

想說，這樣應該好了吧。一執行，哇咧，為什麼又有錯誤，還有log檔給我。這次有錯誤訊息了，表示至少程式有跑到，而錯誤訊息是：

EOFError: EOF when reading a line

。還是來問Google大神吧。還好，還不是很難的問題，大神這次指示往這兒去，會遇到貴人。果然，又是個小問題，原來之前的Victor大大功力太高，都寫GUI的程式，不像小弟我的處女作只是在CONSOLE上跑。所以要把SETUP中的

window = [{'script': "python.py"}],

改成

console = [{'script': "python.py"}],

終於........
休息了，真好！

程式專題之一：Part-1：用python連接資料庫

這次的工作，是要連接local的資料庫，把資料庫中的資料"倒"到網頁的表格中。

有人已經為python寫好資料庫的函式了，那個叫做pyodbc。它可以操作mysql, mssql, excel及MS access。

個人大部份的程式碼抄自於這個地方。另外參考這位大大的論述。其實，pyodbc的主網頁wiki及faq也應該去看看，只是提及MS access的部份實在太少。

其實，我很偷懶的做了一些精省，主要是不想去碰sql語法，以及我要解析的資料庫竟然都用中文當欄位名稱。在python我搞中文搞很久，過一陣子再把我搞中文的心得po出來。不過，這時候只想讓程式可以跑就好，所以就把整個資料拉出來在python中處理了。

程式專題之一：Part-1：Python的網頁代登方法

其實，寫程式是一件事，最重要的應該是用程式解決"生 命"中的問題。

嗯，講得太噁心了。

所以，我第一步是要解決某個行政上的事，把它當作我練功的轉案。至於是什麼事，大家看看應該也可以猜出來。

然後咧，第一步要先用程式代為登入內部網頁。所以需要一個代登功能。
這個也是為什麼我要選擇Python的原因之一，因為看來看去，Python是跟著網路一起長大的，它在網路控制、網頁處理的方面之強大不是隨便講的。雖然JAVA和JAVAscript也是，但是它的語法就是有點讓我.......無法理解 [我知道，我很笨] [畫圈圈]

至於要怎麼做，最簡單的是import cookielib, urllib2進來就是了。
詳請可以看這個：


如何，夠簡單的吧！！

健保核刪之~~我就是要刪

這是今年(2012)第一季的核刪。難得這次的核刪清單這麼快就出現了，以往，沒拖到你徹底忘記病人長得是圓的扁的，是生過什麼病之前，是不會出現的。

這次核刪的特色，勉強來說，就是把支氣管鏡檢查(Fiberbronchoscopy or Flexiblebronchoscopy)都刪掉了。我們主任收到的，是一名加護病房病患，用支氣管鏡來抽掉濃痰並送檢。只有支氣管鏡被刪了，但是其他送出去的檢體卻沒有。

而我收到的是這一張：

一樣，是刪掉支氣管鏡。清單上說理由後附，不過，我們翻過去：

做過最剌激的支氣管鏡切片

這個是real-time EndoBronchial UltraSound(EBUS) guided TransBronchial Needle Aspiration(TBNA)。只是這次做的是心臟旁的病灶，後面一直在跳的那一沱就是心臟。針進去後只離心臟大約1公分。



做intervension 的人，心臟要夠強。

陪伴著我們20多年的朋友：螢光透視平台 (Fluoroscopy) -- 拆解篇

要拆解的那一天到了，出動了3位老牌工程師來處理。這台機器似乎也是其中兩位工程師來組裝的，當初，全台好像總共安裝了5台。而我們家這一台應該是最後一台報廢的吧，我不知道他們會不會有我這種不捨的感覺。

▼▼▼▼工程師打開主機，一個個零件、模組拆卸下來

陪伴著我們20多年的朋友：螢光透視平台 (Fluoroscopy) -- 最後身影

隨著科技的進步，不只開發製造了新東西，也創造了不少的濱臨絕種或已絕種的機器和技術。在我們胸腔科，最明顯的就是所謂的支氣管攝影(bronchogram)，在CT發明之後，它的重要性越來越不重要，然後，在10多年前宣告絕跡。

在台灣，因為給付全部來自於"中央健保局" ，給付的高低也造就了不少濱臨絕種的檢查。螢光透視攝影指引的支氣管鏡檢查就是其中一個，因為螢光透視攝影的機器+場地成本高於超音波指引的支氣管鏡檢查，給付又是超音波指引比較高(差了3倍以上)，因此，它只剩台北榮總胸腔部有維持著這樣的傳統及設備。

▼▼▼ 這就是陪伴我們20多年的 螢光透視攝影室 (Fluoroscopy) 裏的設備

新．科技防癌美學 – Pentax SAFE-3000 自體螢光支氣管鏡

時間拉回到去年九月的韓國首爾的世界肺癌大會，諾大的Exhibition，除了滿滿的poster外，就是廠商區的promotion。這兒不是台北電腦展或是車展，沒有熱舞的show girl(即使有，在學術氣息充斥的場上也格格不入吧)，但是只要是人群聚集的地方，就是科技和學術之所在。在胸腔科的武器，氣管-支氣管鏡，當然也是廠商參展的大宗。

1967年後，隨著日本池田等人研製的光纖支氣管鏡(或稱為軟式支氣管鏡)應用到臨床，我們終於可以用比較簡單的方式，不須要全身麻醉就可以直視氣管內的構造。它可以探查是否有構造上的問題，是否有腫瘤的生長。同時，一些檢查步驟，如經支氣管鏡肺切片（TBLB），支氣管肺泡灌洗（BAL）技術及各種介入性治療工具的出現，支氣管鏡檢查術在臨床上的應用又得到了進一步的普及和提高。近年來，隨著電子零件的縮小化，攝影機也可以做到支氣管鏡中，使得電子式的支氣管鏡逐步在取代光纖支氣管鏡。也因此開發了螢光支氣管鏡的製作。目前，支氣管鏡不僅可被用於診斷和治療氣管支氣管內病變，甚至可以幫助支氣管肺癌的分期，指導治療。

自體螢光支氣管鏡--測試照流出

之前提到，全台第一部的SAFE-3000在台裝機了。那，效果如何呢？？
今天就丟個兩張測試照上來供大家看看：

(PS. 為了病患隱私，我也無法從照片中辨識出是誰了)。


▲這是一般的白光照片(不是孫燕姿的綠光喔...誤)，即所謂的White light bronchoscopy。可以看到氣管內紅紅的、正常的黏膜。在中央部份(綠色箭頭圍起)即是腫瘤組織，有沒有和週邊氣管格格不入的感覺呀？

PEAK 電漿手術刀

這是我常看的癮科技上介紹的，已完成臨床測試且有不錯評價的 PEAK 電漿手術刀。這把手術刀與傳統的電刀( 如 bovie cutter )不同之處在於它採用脈衝電漿能量來切割組織。電漿的產品不少，常用的如家中的平面電視。而電漿在醫療界的用途也不少，最常用的是內視鏡中用來止血、切割和清除腫瘤。這回，電漿走出陰暗的內視鏡中，到我們平常用的手術上。

18禁 - 展示影片

網站上的介紹影片，傳說相當血淋淋呈現實況的影片。其實看過了之後，我個人覺得還算好，只是那示範影片用的是離體外科練習用的皮膚組織，無論是用什麼刀都沒什麼出血量，沒辦法展現這種刀的優點。不過，光是那個切下去的順暢度和沒有電刀產生的煙，就值得了。

再提一下，剛有提到，電漿本身就可以用來止血，而且它影響組織的深度也相對於電刀和雷射而言是較淺的，相當適合來當手術刀。

美國剛通過使用，台灣的健保會不會給付呢？................當我沒問好了。

引用來源：癮科技
PEAK PlasmaBlade 新聞稿