趙恆勝醫師:台北榮總 胸腔部 一般胸腔科 主治醫師
      陽明大學 醫學院 醫學系 部定講師
      陽明大學 生物醫學資訊研究所 博士班學生
主治科別:胸腔內科        經歷:台北巿立聯合醫院中興院區 內科主治醫師
 專長一:胸腔暨重症專科醫師      哈佛大學生理訊號研究中心進修研究員
 專長二:介入性支氣管鏡學       台北榮總支援署立金門醫院 內科主治醫師
 專長二:肺癌專科醫師         台北榮總胸腔部臨床研究醫師
 專長三:胸腔超音波專科醫師      台北榮總胸腔部住院總醫師
 專長四:睡眠醫學會會員        台北榮總住院醫師
  

星期六, 三月 03, 2012

如何去利用 "雲端空間" (三) -- DropBox 及 SugarSync 的 ipad端下,GoodReader使用經驗

最近我到陽明大學醫學系,帶 PBL課程。面對的是大學3年級的學生,讓我驚訝的是,他們現在課堂上的作業、共同筆記等,並不是用email來傳遞檔案。而是全往DropBox上丟。看來,雲端是趨勢了,尤其在檔案分享、協作平台及備份工作這些方面實在擴展迅速。

好,上次說過了DropBox 及 SugarSync 的電腦端(PC, Desktop, Laptop)使用經驗,今天來講講手持裝置的使用好了。尤於我只有ipad,沒有iphone或其他Android系統的機器,所以只著重在ipad上的使用。


星期四, 三月 01, 2012

USB-Powered DNA Nanopore Sequencing for $900

要談DNA sequence之前,我們先來段YOUTUBE的影片,看看生物體是怎麼工作的吧!



這一段影片是大家體內的 DNA複製狀況的電腦繪圖,實際的速度可能快上10倍20倍,DNAPolyerase III實際工作的速度是 1500 bp/s,出錯的機會小於百萬分之一。其實在上面的影片,根本上,這些蛋白質在工作時看起來就像一部有效率的機器組件,只是構成不是硬梆梆的金屬,而是一球一球的有機化合物。

再回來談DNA sequence。現在DNA sequence,即使是號稱 next generation sequencing(NGS),用的還是shutgun-method + hybridization + fluorescence等的"有機" + "化學"方法。

那,有沒有可能用"類似"DNA replication時的方法,把它丟進一個nano machine,直接一個個base讀出來呢?這有人想過,像利用nano tubule:

下面這個似乎也是一個好辦法,可以把成本壓到1000美金以下。
http://medgadget.com/2012/02/usb-powered-dna-nanopore-sequencing-for-900.html

只是,接下來呢?每地的DNA Sequencing的結果,應該很難分析吧。

星期日, 二月 19, 2012

做過最剌激的支氣管鏡切片

這個是real-time EndoBronchial UltraSound(EBUS) guided TransBronchial Needle Aspiration(TBNA)。只是這次做的是心臟旁的病灶,後面一直在跳的那一沱就是心臟。針進去後只離心臟大約1公分。



做intervension 的人,心臟要夠強。

星期三, 二月 08, 2012

Future glass, Future monitor or Future interface

國外的資訊報導網站Engadget及Medgadget,不同而約的報導了 康寧(Corning) 的未來想像。沒錯,就是那個做盤子的 康寧。

http://www.engadget.com/2012/02/05/corning-looks-to-the-future-mainly-right-through-it-video/http://medgadget.com/2012/02/corning-shows-us-a-future-made-of-glass.html

星期四, 一月 26, 2012

T-ray 真的可以做出三相儀?

http://medgadget.com/2012/01/t-rays-one-step-closer-to-the-medical-tricorder.html光是看到 Tricorder,就非得要推一下。

基本上這還是電磁波的應用,其實醫學影像,不管是雷射、x光、核醫,都可以算是電磁波,只是波長差很大。(超音波是震動,不是電磁波)現在,只是在電磁波的頻率等級上再加上 Tera-Hertz,相對於一般的wifi是 Giga-Hertz,差了1000倍。

查了一下,Tera-Hertz的頻譜範圍是介於微波(沒錯,就是微波爐用的微波)的1mm和遠紅外光的0.1mm之間。在這個區間,剛好就是電磁波同時具有光的粒子性和波的特性的區間。用現代的半導體技術可以很容易的就做出大體積的發射陣列和感應器陣列。

但是它的安全性如何?
由於剛好介於電磁波規範和雷射規範的邊緣地帶,所以剛好都沒好好的研究它的安全性。也就是說,是個生產論文的好地方。

星期四, 一月 19, 2012

Bronchoscopy 教學網站

http://www.thoracic.org/clinical/best-of-the-web/pages/patient-education/educational-resources-for-bronchoscopy.php話說,網路上的資訊也遵守80/20律。也就是說,有80%的網路資訊可能對你而言是垃圾,而你要的資訊也只有80%可以從網路得到。

為了讓大家不要迷失在網路中,ATS很窩心的幫大家準備了:Best of the web(最佳蜘蛛網?)。例如Bronchoscopy,它在上百萬的google search results中,去除掉不專業的"dictionary"或"encyclopedia",再去除掉論文收集器的文章("entrez","Pubmed"),再去除病患衛教文("patient information"),最後剩38萬多個網站,瀏覽了前100個(一開始就這樣做不行嗎?),從中推薦了10個。有興趣的同好和科裏的fellow,請務必上去看看。

星期三, 一月 18, 2012

One Thousand Genome Project 的初步報告

One Thousand Genome Project,聽起來就很威的感覺。從2008年開始的計畫,也在去年(2011)10月,在nature上發表完成後的第一份初步報告。原文如下:


在手上的監視病患生理訊號

http://medgadget.com/2012/01/airstrip-receives-ce-mark-for-mobile-monitoring-solutions.html醫療雲端化的時代,隨時掌握病患資訊變成了很重要的"達成雲端應用"的手段之一。其實在美國,歐盟及各大醫療器材研發廠商早就在做這一塊了,更不用說,很多標準其實早就在"上個世紀"就訂出來了。現在喊雲端根本是太慢了。

左側這是手機服務,已經取得FDA 510k的認證。





我國什麼時候才會有這些認證呢?

星期二, 十二月 27, 2011

在impct factor之外 -- 談Google Scholer Citation 及 Microsoft Academic Search 服務

http://k-review.com.tw/2011/11/01/1049/之前在我的文章 -- 學術界的遊戲:impact factor -- 中,就有提到,由於impact factor的提出和採集方式怪怪的,還有不少的疑點和邏輯上的瑕疵。

在左邊這一篇 -- 撤稿論文不死 --,就是談到我其中的論點,只要刊出來,就會有人"錯誤"的引用"錯誤"的內容,寫出"錯誤"的文章。一整顆樹都壞了(可以說是學術界的"毒樹"理論嗎?)。

所以,有人考量是不是以page rank來表示一篇文章的價值。這個計量值是google用在計算網頁的實用度和熱門度的一個值,只要安裝google toolbar就會看到。不過,為了不讓湯普生公司專美於前,兩大搜尋引擎在自己搜尋的演算法之外又加上這個附加價值,開始了另一個競爭了。他們紛紛在這兩年中推出了他們定義的定量值。而且,他們的運作和參考用途是"免費"的喔!

星期一, 十二月 26, 2011

安裝 LOINC,STEP BY STEP

醫學資訊學原理 -- Electronic Health Record System
作業報告:HW2_2011-11-14