醫學資訊學原理 -- Standards in biomedical informatics
作業報告:HW2_2011-10-24
由於RxNorm須要載入到RDBMS來做儲存和運作,所以先下載xampp來使用。裝好後可以啟動其中的Apache和mysql來使用。如下:
在註冊UMLS後,下載RxNorm_full_10032011.zip。再解壓縮到任一目錄中。
然後在mysql中建立RxNorm的資料庫:
因為xampp的mysql是安裝在C:\xampp\mysql中,而可以使用的id和pass以及host_id及資料庫名稱必須填在其中的scripts\mysql\之下的批次檔:Populate_mysql_rxn.bat之中:
但是這樣似乎還不行,在執行過程中,會找不到所有的.RRF檔案,而出現ERROR 2 (HY000) at line 1: File 'RXNATOMARCHIVE.RRF' not found (Errcode: 2)。
所以必須把rrf/之下的.RRF檔案copy到scripts\mysql\之下。
然後即可以執行這個Populate_mysql_rxn.bat的批次檔。會花相當多的時間在轉換資料之上(轉換前有近700m,轉後有1g的資料量)
安裝完之後的樣子:
之後再執行查詢的動作:
這樣就完成RxNorm的安裝了。
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